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团子 AI 学院 · 进攻组 · 工具精读 S11

一张地图,装下肿瘤学

OnCo 入门:什么是知识图谱,医生和 AI 怎么用它

onco.cc · 开源肿瘤学知识图谱 · 数据截至 2026 年 10 月 18 日
非商业教学课件 · 讲者 丁海祥

夜班结束 · 办公室

一个问题,二十个标签页

病人家属问:“三阴性乳腺癌,现在有什么新药?”

你打开指南、PubMed、药企官网、试验注册网站……一小时后,桌面上是二十个标签页,脑子里是一团乱麻。

资料一点不缺,
缺的是一张地图。

AI 生成示意图

如果有人把
整个肿瘤学,
画成一张能点的地图呢?

今天介绍的 OnCo,就是在做这件事。

第一幕

OnCo 是什么

一个公开、带引用、人人可改的肿瘤学知识图谱

01

一句话

每个癌种、药物、靶点、试验、机构和想法,
各占一页,彼此相连

19,715个对象(页面)
474个癌种
6,086项临床试验
1,694个靶点
2,586篇关键论文

数字来自 OnCo 官方 API 的 meta.json(2026-10-18 构建),网站每次更新都会变。代码 MIT 开源,数据 CC BY-NC 4.0,由 Jude Gomila 发起。

关键词 · 知识图谱 Knowledge Graph

点是“东西”,线是“关系”

普通网站像一本书,一页一页往下翻。知识图谱更像一张网:每个点是一个对象(一种癌、一个药、一个靶点),每条线写明它们是什么关系。

所以你可以从任何一点出发,顺着线走到所有相关的东西。

🏈 像战术板:每个球员一张卡,连线就是传球路线

AI 生成示意图

举个真实的例子

从一个癌种,走到一篇论文

癌种三阴性乳腺癌TNBC 靶点TROP2肿瘤表面蛋白 技术ADC抗体偶联药物 药物戈沙妥珠单抗sacituzumab 试验/论文关键试验原始出处

示意图为课程自绘,简化了真实关系。在网站上,每个方框都是一页,点进去还能继续往外走。

每一页都分三层

先说人话,再说术语,最后给出处

第一层 · TL;DR

一两句大白话

新手也能看懂这是什么。“TL;DR”是英文网络用语,意思是“太长不看版”。

第二层 · 技术层

给专业读者

分型、机制、数据、标准治疗、在研管线。术语都有悬停解释。

第三层 · 来源

一手出处 + 核对日期

每条记录至少链接一个原始来源,写明最近一次核对是哪天。

读法:先看 TL;DR 判断要不要深读,重要的事一定回到原始来源核实

第二幕

六个入口,别迷路

网站有一百五十多个子页面,记住这六个大门就够了

02

课堂演示 · 5 分钟

回答开场那个问题

STEP 1打开癌种页onco.cc/cancers/tnbc
STEP 2读 TL;DR30 秒知道大局
STEP 3看路线图TNBC / TROP2 ADC 路线图
STEP 4点进关键试验回到原始论文核实

TNBC 页面的 TL;DR(课程翻译)

一种缺少三种受体(雌激素受体、孕激素受体、HER2)的乳腺癌,而其他乳腺癌正是靠这些受体来治疗的。几十年来它都是最难治的亚型;2020 年以来,免疫治疗和 ADC 改变了这一点。原文英文,见 onco.cc/cancers/tnbc(2026-10-19 读取)

第三幕

医生和研究者怎么用

不是查一个答案,而是顺着一条路线读下去

03

阅读路径示范 · 放疗、肌肉与骨骼

一条路线,九站

① 放射治疗前线 → ② 放疗路线图先看整体:放疗技术怎样一代代演进
③ 恢复与再生 → ④ 治疗后的肌肉与力量治疗带走了什么,什么能回来
⑤ 肌少症 · CT 体成分 → ⑥ 恶病质通路怎么量肌肉,肌肉为什么会流失
⑦ 抗阻训练 → ⑧ 治疗相关骨丢失 → ⑨ 瓶颈什么有效,骨怎么办,领域卡在哪

六条完整路线(含外科、读懂一个癌种、找课题、AI 数据)见课后 GitHub 链接。

AI 生成示意图

地图最有用的地方,是看出哪里还是空白

地图上没画的地方,可能就是你的课题

✅ OnCo 已经有的

  • 肌少症、CT 体成分测量
  • 恶病质通路与 GDF-15 靶向治疗
  • 抗阻训练与蛋白质补充
  • 治疗相关骨丢失、骨改良药物

⬜ 2026-10-19 检索时还没有

  • 专门的“放射性骨骼肌损伤”条目
  • 专门的“骨质疏松”条目
  • 放疗直接损伤肌肉的机制页

✍️ 写基金背景时:“现有开放知识库尚无系统整理”就是一句有依据的立项理由

另外两个找课题的入口:瓶颈(拖慢领域的约束)和 创意(每个假设附了检验方法)。

第四幕

让 AI 也能读这张地图

网页给人看,接口给机器读

04

关键词 · API 接口

像检验科的标准化报告单

网页是给人看的,排版好看但机器难读。API 是同一份数据的“标准格式版”,程序和 AI 可以直接读取、筛选、统计。

OnCo 的接口免费、不需要密钥;还专门给大模型准备了 llms.txt 和每个对象一份的 Markdown 说明。

🏈 API 就是统一格式的战术手语,任何球员一看就懂

# 在电脑终端运行(只需 Python 3) git clone https://github.com/TUANZIDING/onco-cc-guide cd onco-cc-guide python3 示例/检索示例v1.0.py sarcopenia # 输出:类型 + 名称 + 网页链接 [term] Sarcopenia https://onco.cc/terms/sarcopenia/

MCP(让 AI 助手直接调用 OnCo 的接口协议)官方已写好,但 2026-10-19 尚未发布到 npm,需要从源码构建。相关课:MCP 协议。

用之前,先记住五条

安全边界

01网站自己声明:仍在建设中,可能不完整、过时或有错。

02不是医学建议。临床决策回到原始来源和指南。

03“已获批”看国家:先在页眉选择国家,美国获批不等于中国获批。

04数据许可 CC BY-NC 4.0:教学和个人使用免费,须署名;商业使用要付费授权。

05把病例交给 AI 查资料时,先去掉病人隐私信息。

这节课带走

三句话

01

点是东西,线是关系

知识图谱让你从任何一点出发,走到所有相关的东西。

02

先 TL;DR,再回出处

大白话判断要不要深读,重要的事一定核对原始来源。

03

空白就是机会

地图上没画的地方,可能就是你下一个课题。

One more thing · 课堂练习

选一个你科室最常见的癌种,走一遍四步

打开癌种页 → 读 TL;DR → 看一条路线图 → 点进一项关键试验。然后用一句话告诉同桌:这个癌种最近五年最大的变化是什么?证据有多强?

进阶:让 AI 读 onco.cc 上的同一页,对比它的总结和你自己读到的,有哪处不一样?

丁海祥 · 团子 AI 学院原创非商业教学课件 · 图片为 AI 生成或自绘示意,非 OnCo 截图
Data from OnCo (onco.cc), CC BY-NC 4.0 · 课程与 OnCo 官方无隶属关系 · 内容不构成医学建议